Nationale Zytometrie-Plattform

Tätigkeiten

Die zentrale Einrichtung bietet ein breites Spektrum an Dienstleistungen und ist offen für nationale und internationale wissenschaftliche Kooperationen. Die Nationale Zytometrie-Plattform (NCP) bietet Zugang zu Einzelzelltechnologien auf der Grundlage von Durchflusszytometrie, Mikroskopie, Bildzytometrie und Massenzytometrie. 

Technologien

Einzelzellanalyse

• Massenzytometrie
  • CyTOF XT™ (135 Kanäle für die gleichzeitige Messung von mehr als 40 zellulären Markern)

• Durchflusszytometrie (konventionelle fluoreszenzbasierte Analysegeräte)
  • BD LSRFortessa (5 Laser: 355nm, 405nm, 488nm, 561nm, 628nm; 20 Kanäle)
  • 2 x Novocyte Quanteon (4 Laser: 405nm, 488nm, 561nm, 628nm; 27 Kanäle)

• Einzelzellsortierung
  • 2 x BD FACSymphony™ S6 Cell Sorter (5 lasers: 355nm, 405nm, 488nm, 561nm, 637nm; 24 Kanäle)
  • BD Influx (4 Laser: 355 nm, 405 nm, 488nm, 640 nm; 16 Kanäle)

• Bildzytometrie (Kombination von Durchflusszytometrie und Mikroskopie für ein detailliertes Bild der Zelle und ihrer intrazellulären Bestandteile)
  • Image Stream MarkII (5 Laser: 405nm, 488nm, 561nm, 640nm, 785nm; 12 Fluoreszenzkanäle; 20x 40x 60x Vergrößerung)

• Einzelzellpartionierung und Barcoding
  • Chrom iX

Mikroskopie

• Konfokale Mikroskopie
  • LSM880 FastAiry – Zeiss (5 Laser: 405nm, 488nm, 543nm, 594nm, 633nm)

• Sichtbare und Epifluoreszenzmikroskopie
  • Axio Observer Z1 – Zeiss
  • Evos – Thermofischer
  • Eclipse NI-E- Nikon

Multiplex-Immununtersuchungssysteme

• Multiplexing-Imager
  • MESO QuickPlex SQ 120 – MSD (Hochmultiplexsystem auf Basis der Elektrochemilumineszenz zur Durchführung von Assays im Format 10 x 96 oder 4 x 384)

Strategie für die Datenanalyse

Um der Notwendigkeit der Integration multidimensionaler Daten, Metadaten und klinischer Informationen gerecht zu werden, schlagen wir eine auf Business Intelligence basierende Strategie vor, die in einer kürzlich erschienenen Veröffentlichung beschrieben wurde: (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33957013/ und https://public.tableau.com/app/profile/fanny2212).

Die Einrichtung bietet auch die Möglichkeit, Daten mit bekannten Programmen (FlowJo, Cytobank, Infinicyt und CellEngine) zu analysieren und bei der statistischen Auswertung der Daten zu helfen (Qluocore, GraphPad Prism).

Schulung

Die Nationale Zytometrie-Plattform bietet der wissenschaftlichen Gemeinschaft in Luxemburg und der internationalen Gemeinschaft im Rahmen von Kooperationen mit verschiedenen Instituten und Universitäten Schulungen in Zytometrie und multidimensionaler Datenanalyse an.