Science des données multi-omiques (modas)
Le Groupe de recherche « Science des données multi-omiques » (« Multi-omics Data Science »- MODAS) se concentre sur la mise au point de méthodes computationnelles et statistiques avancées d’analyse et d’interprétation de données biomédicales.
activités
Le groupe de recherche MODAS se concentre principalement sur les données obtenues dans le domaine de la biologie du cancer par le biais du profilage moléculaire à haut débit. Nous nous attachons à extraire des signaux biologiques pertinents et des caractéristiques prédictives de tumeurs et de tissus environnants selon diverses modalités : méthylation de l’ADN, expression de l’ARN, abondance de protéines et images histopathologiques de tissus. L’intégration des données correspondantes améliore notre compréhension du cancer et conduit à une meilleure stratification et à un meilleur traitement des patients. Le groupe est particulièrement intéressé à contribuer à la recherche translationnelle par le biais de solides collaborations au sein du LIH, du LNS et à l’étranger. Les membres de l’équipe permettent d’activer des partenariats de recherche interdisciplinaires qui bénéficient de la diversité de leurs expertises en biostatistique, en analyse et intégration à grande échelle de données multi-omiques, ainsi qu’en matière d’apprentissage automatique et de programmation scientifique.
Petr Nazarov dirige le Groupe de recherche MODAS au Luxembourg Institute of Health et est professeur adjoint invité à l’Université du Luxembourg. C’est en 2000 qu’il a obtenu son diplôme de physicien à la Belarus State University, avant de décrocher son Ph. D. en biophysique à la Wageningen University en 2006. Il travaille depuis lors au Luxembourg Institute of Health, d’abord en tant que chercheur postdoctoral, chercheur et enfin chef de groupe. Ses principales compétences résident dans le domaine de la biostatique, de l’analyse de données, de l’apprentissage automatique et de la génomique. Ses travaux portent principalement sur l’analyse de transcriptomes cancéreux. Il a également œuvré à la déconvolution de signaux transcriptomiques et épigénomiques provenant de tumeurs hétérogènes.
Nazarov
Projets et essais cliniques
Projets de recherche
Les membres du groupe ont mené les projets de recherche suivants ou y ont contribué :
- « La décomposition de transcriptomes mixtes pour la classification d’échantillons de tumeurs hétérogènes (Decomposition of mixed transcriptomes for classification of heterogeneous tumour samples) (DEMICS) », Fonds national de la recherche du Luxembourg (FNR), 2018-2020.
- « Analyse longitudinale des gliomes au Luxembourg : profilage fonctionnel ex vivo et in vivo des gliomes récidivants (Glioma Longitudinal Analysis in Luxembourg: ex vivo and in vivo Functional Profiling of Recurrent Gliomas) (GLASS-LUX) », FNR, 2021-2024.
- « Ciblage les cellules responsables de la propagation tumorale dans le glioblastome : des perspectives mécanistes à la médecine de précision (Targeting tumor propagating cells in glioblastoma: from mechanistic insights to precision medicine) (SUNRISE) », Télévie PDR, Luxembourg-Belgique, 2021-2024.
Membres de l’équipe
Publications scientifiques
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Digital voice-based biomarker for monitoring respiratory quality of life – 01/10/2024
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Metformin impacts the differentiation of mouse bone marrow cells into macrophages affecting tumour immunity – 30/09/2024
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Patient-based multilevel transcriptome exploration highlights relevant chemokines and chemokine receptor axes in glioblastoma – 30/09/2024
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PARK7/DJ-1 deficiency impairs microglial activation in response to LPS-induced inflammation – 16/07/2024
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consICA – 13/07/2024
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AllergoOncology – 01/01/2024
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Most accurate mutations in SARS-CoV-2 genomes identified in Uzbek patients show novel amino acid changes – 31/05/2024
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Enhancing the opportunities for cholangiocarcinoma precision therapy – 16/01/2024
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Glioblastoma-instructed microglia transition to heterogeneous phenotypic states with phagocytic and dendritic cell-like features in patient tumors and patient-derived orthotopic xenografts – 02/04/2024
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Rel Family Transcription Factor NFAT5 Upregulates COX2 via HIF-1α Activity in Ishikawa and HEC1a Cells – 25/03/2024
Postes à pourvoir
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