Plateforme Nationale de Cytométrie
La plateforme NCP (« National Cytometry Platform », en français « Plateforme Nationale de Cytométrie ») met à la disposition de la communauté scientifique luxembourgeoise la meilleure technologie, associée à une conception expérimentale réfléchie et à des approches avancées d’analyse des données.
activités
L’installation centrale offre un large éventail de services et est ouverte aux collaborations scientifiques nationales et internationales. La plateforme (NCP) donne accès aux technologies unicellulaires basées sur la cytométrie en flux, la microscopie, la cytométrie d’image et la cytométrie de masse.
Technologies
Analyse unicellulaire
- Cytométrie de masse
- CyTOF XT™ (135 canaux pour la mesure simultanée de plus de 40 marqueurs cellulaires)
- Cytométrie en flux (analyseurs conventionnels basés sur la fluorescence)
- BD LSRFortessa (5 lasers : 355nm, 405nm, 488nm, 561nm, 628nm ; 20 canaux)
- 2 x Novocyte Quanteon (4 lasers : 405nm, 488nm, 561nm, 628nm ; 27 canaux)
- Tri unicellulaire
- 2 x BD FACSymphony™ S6 Cell Sorter (5 lasers: 355nm, 405nm, 488nm, 561nm, 637nm; 24 canaux)
- BD Influx (4 lasers : 355 nm, 405 nm, 488nm, 640 nm ; 16 canaux)
- Image Cytométrie (combinaison de la cytométrie de flux et de la microscopie pour une image détaillée de la cellule et de ses composants intracellulaires)
- Image Stream MarkII (5 lasers : 405nm, 488nm, 561nm, 640nm, 785nm ; 12 canaux de fluorescence ; grossissement 20x 40x 60x)
- Partitionnement et codage à barres des cellules uniques
- Chrome iX
Microscopie
- Microscopie confocale
- LSM880 FastAiry – Zeiss (5 lasers : 405nm, 488nm, 543nm, 594nm, 633nm)
- Microscopie en lumière visible et en épifluorescence
- Axio Observer Z1 – Zeiss
- Evos – Thermofischer
- Eclipse NI-E- Nikon
Systèmes de dosage immunitaire multiplex
- Imageur de multiplexage
- MESO QuickPlex SQ 120 – MSD (système de multiplexage élevé basé sur l’électrochimioluminescence pour réaliser des analyses au format 10 x 96 ou 4 x 384)
Stratégie d’analyse des données
Pour répondre à la nécessité d’intégrer des données multidimensionnelles, des métadonnées et des informations cliniques, nous proposons une stratégie basée sur la Business Intelligence décrite dans une publication récente : https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33957013/ and https://public.tableau.com/app/profile/fanny2212
L’établissement offre également la possibilité d’analyser les données avec des logiciels connus (FlowJo, Cytobank, Infinicyt et CellEngine) et d’aider à l’évaluation statistique des données (Qluocore, GraphPad Prism).
Formation
La Plateforme NCP offre des formations en cytométrie et en analyse de données multidimensionnelles à la communauté scientifique luxembourgeoise et internationale dans le cadre de collaborations avec différents instituts et universités.
Cosma
Projets et essais cliniques
Membres de l’équipe
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Raul
Da Costa Engineer Flow, Mass and Imaging Cytometry -
Lyazid
Drissi Yahyaoui PhD Student -
Mario
Gomez Engineer Flow, Mass and Imaging Cytometry -
Fanny
Hedin Engineer Flow, Mass and Imaging Cytometry -
Céline
Hoffmann Scientist -
Maria
Konstantinou Engineer Flow, Mass and Imaging Cytometry -
Tran
Luong PhD Student -
Cécile
Masquelier Engineer Flow, Mass and Imaging Cytometry
Publications scientifiques
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Multiomics approaches disclose very-early molecular and cellular switches during insect-venom allergen-specific immunotherapy – 22/02/2024
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Proteome analysis of propolis deciphering the origin and function of its proteins – 01/02/2024
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Early-to-mid stage idiopathic Parkinson’s disease shows enhanced cytotoxicity and differentiation in CD8 T-cells in females – 20/11/2023
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Actin cytoskeleton remodeling at the cancer cell side of the immunological synapse – 21/09/2023
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Correlative light and electron microscopy to explore the lytic immunological synapse between natural killer cells and cancer cells – 05/06/2023
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Actin cytoskeleton depolymerization increases matrix metalloproteinase gene expression in breast cancer cells by promoting translocation of cysteine-rich protein 2 to the nucleus – 15/05/2023
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High-dimensional immune profiles correlate with phenotypes of peanut allergy during food-allergic reactions – 24/06/2022
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Allergenic risk assessment of cowpea and its cross-reactivity with pea and peanut – 01/12/2022
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Fish Processing and Digestion Affect Parvalbumins Detectability in Gilthead Seabream and European Seabass – 03/11/2022
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Early-to-mid idiopathic Parkinson’s disease shows a more cytotoxic but declined CD8-regulatory peripheral immune profile – 22/07/2022